牡丹江地区共有三所三本大学，具体如下：
牡丹江大学：
黑龙江省牡丹江市，专科。
黑龙江幼儿师范高等专科学校：
虽然其办学层次为专科，但不在牡丹江地区，因此不在此列。
黑龙江农业经济职业学院：
黑龙江省牡丹江市，专科。
建议：
牡丹江大学和 黑龙江农业经济职业学院均为专科院校，如果考虑三本大学，可能需要考虑其他省份或地区的院校。
牡丹江师范学院是一所本科学校，虽然其办学层次为本科，但不在三本大学的范畴内。
综上所述，牡丹江地区并没有传统意义上的三本大学。如果需要选择本科学校，牡丹江师范学院是一个不错的选择。