民办大学既包括二本也有三本。民办大学是指由社会力量举办的高等教育机构，其办学性质与学校的录取批次是两个不同的概念。民办本科院校经过国家评核通过可以升级为二本院校。同时，虽然大部分民办本科院校在录取批次上属于第三批，但也有个别发展较好的民办本科院校具备录取第二批考生的资格，甚至有的民办院校已经成立了博士办学点，如西湖大学。
需要注意的是，由于政策和管理安排的变更，一些省份已经不再区分一本、二本、三本，因此在社会上可能存在将民办大学统一视为三本的看法。然而，从严格意义上讲，民办大学包括二本和三本，并且存在民办院校升级为二本院校的可能性。
综上所述，民办大学既包括二本也包括三本，具体分类取决于学校的办学实力和国家的评核标准。