民办独立学院和民办大学都是利用非国家财政性教育经费举办的高等教育机构，但它们之间存在一些关键的区别：
办学主体
民办大学：由企业事业组织、社会团体及其他组织和公民个人利用非国家财政性教育经费，面向社会举办的高等学校。民办大学有独立的校名、组织机构、师资和校园，独立颁发毕业证书。
独立学院：是实施本科以上学历教育的普通高等学校与国家机构以外的社会组织或者个人合伙，利用非国家财政性经费举办的实施本科学历教育的高等学校。独立学院一般设在某个大学的名下，可能和挂名的大学同在一个校园，也可能有师资等方面的共享和交流。
办学层次
民办大学：办学层次包括本科和专科。
独立学院：一定是本科，不包含专科。
学历证书
民办大学和 独立学院的毕业生都可以获得国家承认的学历证书，毕业证书可以在中国高等教育学生信息网上查询。独立学院的毕业证书上加盖的是某某大学某某学院印章，而民办大学的毕业证书上加盖的是学校校名印章。
学费
民办大学学费在16000-30000元/年左右。
独立学院学费在16000-20000元/年左右。
法律地位
民办大学根据民办教育促进法设立，具有独立的法人资格，能独立承担民事责任。
独立学院根据教育部的行政规章设立，依托于普通高等学校，也具有独立的法人资格。
总结：
民办独立学院和民办大学虽然都属于民办性质，但它们在办学主体、办学层次、学历证书和学费等方面存在明显的区别。独立学院一定是本科，且通常设在某个大学名下，而民办大学则包括本科和专科，有独立的校名和校园。两者在毕业证书上的印章也有不同，独立学院使用合作院校的印章，而民办大学使用自己的印章。在选择就读时，学生可以根据自己的需求和条件，选择合适的学校类型。