民办大学既包括二本也有三本。民办大学是办学性质，而二本和三本是录取批次，这两者是不同的概念。民办本科院校经过国家评核通过也可升级为二本院校。目前，大部分民办本科院校录取批次属于第三批，但也有个别发展比较好的民办本科院校具备录取第二批的考生资格，甚至成立博士办学点，例如西湖大学。
另外，需要注意的是，目前二本和三本已经合并了，民办本科也都属于二本了，统称为本科二批。因此，认为民办本科院校都是三本或者没有二本院校的观点是有失偏颇的，也是不科学的。
综上所述，民办大学既包括二本也包括三本，具体属于哪个批次取决于学校的办学实力和评核结果。