三本大学升二本后，毕业证 会存在一些区别。虽然都是本科毕业证书，但三本和二本的毕业证在以下方面有所不同：
毕业证上显示的内容
二本毕业证上通常显示的是学校的校名，例如“××大学”。
三本毕业证上则显示的是“××大学××学院”的字样，同时还会加盖三本院校的公章。
毕业证的认证与效力
虽然三本院校升级为二本院校，但其毕业证仍然无法与教育局认证的二本院校毕业证完全相比较。三本院校的毕业证在社会上可能会受到一定的质疑，因为其办学性质和层次与二本院校有所不同。
毕业证的编码与公章
二本和三本毕业证的编码首部以及公章也有所不同。二本证书使用的是本校的公章，而三本证书则使用的是本学院的公章。
综上所述，虽然三本大学升级为二本大学后，学生在毕业时获得的毕业证书仍然是本科文凭，但在毕业证的具体显示内容和认证效力上，三本与二本还是存在明显的区别。因此，建议学生在选择学校时，应充分了解这些差异，以便更好地规划自己的职业发展路径。