南京江宁区的二本大学包括：
南京工程学院：
南京工程学院位于南京江宁方山风景区，是一所以工学为主，经济学、管理学、文学、法学、艺术学、理学等协同发展的江苏省属普通本科高校。南京工程学院在工程学科方面成绩斐然，就业质量很高，被誉为二本中的“小清华”。
南京晓庄学院：
南京晓庄学院是一所公办全日制普通本科院校，位于南京市江宁区。学院以培养高素质应用型人才为任务，是教育部应用科技大学改革试点战略研究单位、中国应用技术大学（学院）联盟创始单位、长三角地区应用型本科高校联盟主席单位。
金陵科技学院：
金陵科技学院也是一所公办全日制普通本科院校，位于南京市江宁区。学院以培养高素质应用型人才为任务，是教育部应用科技大学改革试点战略研究单位、中国应用技术大学（学院）联盟创始单位、长三角地区应用型本科高校联盟主席单位。
这些大学在各自的领域都有较高的声誉和影响力，建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的学校进行报考。