重庆对民办大学的拨款方式如下：
生均公用经费补助
对达标的全日制民办本科学校，按本科学生人数每人每年2000元标准给予生均公用经费补助。所需资金由市级全额承担，重点支持教学、科研和实训设备购置、师资队伍建设、教育教学改革、学校正常运转等。每年预计增支1.96亿元。此前对民办本科主要通过专项资金支持。
预拨与年终清算
为减轻疫情对民办学校的影响，重庆对民办学历教育学校和普惠性民办幼儿园采取预拨生均公用经费、年终清算等方式给予补助。各区县教育行政部门可结合实际，按照2020年1月各民办中小学校、民办中等职业学校和普惠性民办幼儿园的在校（园）生数，以2020年生均公用经费补助标准的50%预拨。各民办高校由市教委按2019年10月底在校全日制学生数（不含高职扩招学生）和相应生均经费补助标准的50%预拨，年检结束后进行清算。
专项扶持资金
重庆市级财政每年安排民办学前教育专项扶持资金3000万元、民办高等教育专项扶持资金5000万元，建立生均财政补助机制，推进政府购买民办教育服务。
土地税收政策
民办学校用地纳入城镇建设土地总体规划，并给予优惠。民办学校采用出让方式征用土地，按收支两条线办法先交纳土地出让金，再申请返还。民办学校土地、校舍等主要资产过户免收资产过户税费。
人事政策
民办学校教师纳入“国培”“市培”计划，累计组织培训班10期，受惠3000人次。打破教师职称评定瓶颈，9所民办高校获得中级职称评审权。
融资担保政策
重庆教育担保有限公司授信额达65亿元，为民办教育融资担保项目152个，金额累计18.04亿元。
这些拨款方式旨在支持民办学校的正常运行和发展，提升其教育质量和服务水平，同时通过多种政策工具减轻疫情等不利因素对民办学校的影响。