取消民办三本大学的原因主要有以下几点：
促进教育公平：
取消三本可以打破中国民办高等教育发展的瓶颈，有利于民办高校吸纳优秀生源，促进教育公平，使高校间能够平等竞争。
纠正批次划分不公平：
将二本和三本混在二本一起招生，可以纠正本科批次划分不公平的问题，满足考生个性化选择的需求。
提高招生质量：
取消三本院校可以促使这些院校提高招生质量，避免因为批次划分不合理而导致生源质量参差不齐。
减轻家庭经济负担：
三本院校学费较高，许多家庭一般的学生为了“本科梦”而选择就读独立学院，给家庭带来经济负担。取消三本可以减轻这部分学生的经济压力。
提高教学稳定性：
三本院校的师资力量往往不稳定，聘用老师的工作热情和教学质量难以保证。取消三本有助于提高教学质量和稳定性。
推动高校洗牌：
取消三本录取迫使高校重新洗牌，给考生报考带来双重挑战，有助于优化高校资源分配。
淡化等级制度：
取消一本、二本、三本的概念，未来只有本科和专科的概念，这有助于消除社会对不同批次高校的刻板印象和歧视。
综上所述，取消民办三本大学是为了促进教育公平、提高招生质量、减轻家庭经济负担、提高教学稳定性，并推动高校整体教育水平的提升。虽然取消三本可能会带来一些短期的挑战，但从长远来看，这一举措有利于整个高等教育体系的健康发展和优化。