取消大学三本学籍的流程一般包括以下几个步骤：
提出申请：
学生和家长需要向学校提出申请，并填写相关表格。
学校上报：
学校会将申请上报给教育局进行审查。
教育局审查：
教育局会审查申请，并通知申请人办理学籍注销手续。
办理注销手续：
申请人需要按照通知办理学籍注销手续，这通常需要一到两个月的时间，并且需要得到省教育厅的通知。
此外，注销学籍的原因通常包括：
学生违纪处分中有勒令退学或开除。
学生自动申请退学。
需要注意的是，注销学籍的具体流程和所需材料可能因地区和学校而异，建议提前咨询相关教育管理部门或学校以获取准确信息。