2016年上海二本大学排名如下：
1. 第二军医大学
2. 上海中医药大学
3. 上海海洋大学
4. 上海海事大学
5. 上海工程技术大学
6. 上海电力学院
7. 上海应用技术学院
8. 上海立信会计学院
9. 上海第二工业大学
10. 上海政法学院
11. 上海金融学院
12. 上海电机学院
13. 上海海关学院
14. 上海商学院
建议：
第二军医大学和上海中医药大学在2016年的排名中均位列前三，表现突出。
对于希望在医药领域发展的学生，第二军医大学和上海中医药大学是重点考虑的学校。
对于其他领域的学生，可以根据自身兴趣和职业规划，从上述排名中挑选合适的学校。