三本大学并不都是民办大学。三本大学包括独立院校、民办院校和部分本科院校招收本科三批。虽然三本院校以民办和独立院校为主，但也存在公立高校招收三本的情况。
民办大学与公办大学的主要区别在于资金来源和办学模式。民办大学是由社会力量自筹资金办学的，通常不享受政府的经费补贴，因此在办学模式和收费制度上相对灵活。而公办大学则是由政府出资办学，并享受政府的经费补贴。
此外，三本大学的学费通常较高，这是因为三本院校没有国家经济支持，学校的一切经费都由院方负责，为了维持运转，只能通过提高学费来增加收入。
需要注意的是，随着教育改革的深入，一些省市已经取消了三本招生，将原来的三本批次学校合并到了二本批次。因此，未来的三本大学招生情况可能会有所变化。
综上所述，三本大学并不都是民办大学，但民办院校和三本院校在资金来源、办学模式和收费制度等方面存在一定的关联。在选择三本大学时，考生和家长应充分了解各学校的具体情况，包括办学资质、管理、师资力量等，以确保选择到合适的学校。