云南最好的三本大学公办有以下几所：
云南师范大学商学院：
云南师范大学商学院在云南省三本大学中排名第一，是云南省唯一一所获此殊荣的独立学院。该学院由云南师范大学利用社会投资举办，属普通高等教育本科层次，连续十年入选“中国独立学院排行榜”前十强。
云南大学滇池学院：
云南大学滇池学院是由云南大学申办并经教育部批准的独立学院，依托云南大学的优质教育资源，具有较高的教学质量和学术水平。该学院在云南省三本大学中排名第二。
云南大学旅游文化学院：
云南大学旅游文化学院也是云南大学申办并经教育部批准的独立学院，以旅游文化相关专业为主，注重实践教学和学生综合素质培养。
昆明理工大学津桥学院：
昆明理工大学津桥学院是昆明理工大学举办的独立学院，以理工科为主，注重培养学生的实践能力和创新精神。
云南师范大学文理学院：
云南师范大学文理学院是云南师范大学举办的独立学院，涵盖文、理、工、管、法、经、教育等多个学科，是一所综合性独立学院。
昆明医学院海源学院：
昆明医学院海源学院是昆明医学院举办的独立学院，以医学相关专业为主，致力于培养高素质医学人才。
云南艺术学院文华学院：
云南艺术学院文华学院是云南艺术学院举办的独立学院，以艺术相关专业为主，注重艺术实践和学生创新能力的培养。
这些学院在云南省乃至全国都有一定的知名度和影响力，建议根据个人兴趣和专业需求进行选择。