普洱市目前只有一所本科大学，即 普洱学院。普洱学院是一所公办普通本科高等学校，位于滇西南重镇普洱，是云南属普通本科高等学校，实行省市共管共建，以省为主的管理体制，国家首批卓越农林人才教育培养计划改革试点高校。其前身是创建于1978年12月的思茅师范高等专科学校，是云南第一批建立的四所高等师范专科学校之一。2023年，普洱学院升格为本科高校。
云南热带作物职业学院是一所专科学校，位于世界茶乡、普洱茶都、中国茶城—思茅，是一所立足云南热区，面向全国，辐射东南亚，以培养热带农业生产、经济管理、营销、旅游服务、信息技术等技能型、应用型高级技术人才的公办普通高等院校。