上海最好的二本大学包括以下几所：
上海师范大学：
这所大学是由中华人民共和国教育部和上海市人民政府共建的市属重点大学，入选了多项国家重点发展项目，以文科见长并具备教师教育特色，是一所综合性大学。
上海中医药大学：
这所大学是教育部与上海市人民政府共建的高校，国家首批世界一流学科建设高校，以中医药领域为主，入选了国家“111计划”。
华东政法大学：
这所大学位于金融中心上海，以法学学科为主，兼有经济学、管理学、文学、理学等学科，被誉为“法学教育的东方明珠”。
上海海事大学：
这所大学在航海和物流学科方面具有不错的建设实力，是考生们追捧的高校之一。
上海工程技术大学：
这是一所老牌的二本院校，以培养应用型人才为目标。
上海应用技术大学：
这所大学虽然实力一般，但已经升格为本科多年，有一定的社会认可度。
上海立信会计金融学院：
这所学院在会计领域非常有名，虽然是刚从大专升格为本科，但其社会声誉较高。
上海电力学院：
这所大学在电力专业方面有一定的实力，吸引了不少考生。
上海海洋大学：
这所大学在海洋学科方面具有优势。
上海海关学院：
这所大学以海关、税务、外贸为特色，是行业型财经类高校，学生选择纯海关的专业后有很大机会到海关工作。
这些大学在各自的特色领域都有较高的教学水平和研究实力，根据最新的排名和各个学校的特色，可以认为这些是上海最好的二本大学。建议学生在选择学校时，可以根据自己的兴趣和专业需求，综合考虑学校的学科优势、师资力量和社会声誉。