北京三本最差的大学包括以下几所：
北京工商大学：
因其办学水平较低、师资力量薄弱、教育质量不高而被诟病。
北京青年政治学院：
在学科设置、学术氛围等方面存在缺陷，教学质量也不尽人意。
中国地质大学（北京）：
虽然在地质学方面有一定优势，但整体综合实力较弱。
北京城市学院：
因师资力量不足、实践教学环节欠缺等问题而被评为最差大学之一。
北京邮电大学世纪学院：
北京分数线最低最差的十所本科大学之一。
北京工业大学耿丹学院：
北京分数线最低最差的十所本科大学之一。
北京工商大学嘉华学院：
北京分数线最低最差的十所本科大学之一。
首都师范大学科德学院：
北京分数线最低最差的十所本科大学之一。
北京第二外国语学院中瑞酒店管理学院：
北京分数线最低最差的十所本科大学之一。
这些大学在办学实力、师资力量、教育质量等方面存在不同程度的不足，建议考生在选择大学时谨慎考虑。