厦门大学的三本证指的是 厦门大学嘉庚学院的毕业证和学士学位证。虽然学校在注册的时候使用的是“厦门大学嘉庚学院”这个名称，所有的三本都是这样的，但独立学院没有独自颁发学士学位证书的权利，除非此所独立学院已经转设成为独立建制的民办普通本科院校。
因此，如果某所学院的名称是“厦门大学嘉庚学院”，那么其毕业证书和学士学位证书上均会注明“厦门大学嘉庚学院”。只有在教育部批准该独立学院有独自颁发学位证书的权利后，学士学位证书上才可能注明“厦门大学”。
建议您在选择学院时，要仔细了解该学院的性质和所颁发的证书，以确保获取正确的信息。