现在仍然存在三本大学的原因主要有以下几点：
高考招生制度改革的滞后性：
目前高考招生录取制度改革尚未完全到位，三本作为一种过渡性招生方式仍在沿用。
部分省份考生数量较多：
为了满足更多考生的入学需求，需要通过三本招生来扩大招生规模。
新高考模式的实施不均衡：
开始实施新高考模式的省份已经将一本、二本和三本合并起来，没有三本了。但是没有实行新高考模式的省份，仍然有三本。
独立学院的转设：
三本的独立学院面临转设的命运，有的转为了民办，有的转为了公办，有的甚至终止了办学。这些转设后的学校可能仍然以三本的形式存在。
综上所述，虽然有些省份已经取消了三本，但由于上述原因，三本大学在某些省份和地区仍然存在。