在抗日时期，中国的十二所著名大学可以按以下顺序排名：
1. 中国工农红军大学
2. 延安抗日军政大学
3. 华北人民革命大学
4. 抗大一分校
5. 国民政府军需校
6. 中原军事政治大学
7. 中央大学
8. 北平大学
9. 华北军政大学
10. 苏北抗大九分校
此外，虽然其他资料提到了其他几所著名的大学，但它们在抗日时期的排名不如上述十所大学明确。例如，国立中央大学、国立北京大学、国立清华大学和国立武汉大学被誉为抗战时期的四大名校。
建议：
中国工农红军大学和 延安抗日军政大学在抗日时期具有重要地位，排名第一和第二是合理的。
华北人民革命大学、 抗大一分校、 国民政府军需校、 中原军事政治大学、 中央大学、 北平大学、 华北军政大学和 苏北抗大九分校也是抗日时期的重要教育机构，排名第三至第十。
国立中央大学、 国立北京大学、 国立清华大学和 国立武汉大学作为四大名校，在抗日时期具有很高的声誉，但在具体排名上可能有所争议。
请注意，这些排名主要基于历史资料和当时的知名度，并不代表精确的学术或教育质量评估。