清华大学最顶尖的专业包括：
计算机科学与技术专业：
清华大学计算机科学与技术专业历史悠久，成立于1958年，是中国计算机科学领域内最具影响力和实力的计算机系。
土木工程专业：
土木工程专业是清华大学历史最悠久的系科之一，自1916年建校以来，在建筑与工程领域具有广泛的影响力。
材料科学与工程专业：
该专业由化工系无机非金属材料专业、工程物理系材料物理专业和机械工程系金属材料专业组成，拥有高水平的师资队伍和科研成果。
电气工程自动化专业：
清华大学的电气专业以高压电著称，在电力行业中享有盛誉。
机械工程及自动化专业：
机械工程及自动化专业在清华大学的工科中占据重要地位，为工业现代化进程作出了卓越贡献。
环境科学与工程专业：
环境科学与工程专业的毕业生在环境保护和可持续发展领域具有重要作用。
管理科学与工程专业：
管理科学与工程专业的毕业生在商业管理和决策支持系统中发挥关键作用。
电子信息工程：
该专业培养能够熟练掌握电子信息技术的人才，就业前景广阔。
建筑学专业：
建筑学专业在清华大学工科中同样享有很高的声誉，毕业生在建筑设计和管理领域具有广泛的影响力。
生物医学工程专业：
生物医学工程专业结合了生物学、医学和工程学的知识，培养能够在医疗技术领域工作的专业人才。
这些专业在各自的领域内具有很高的声誉和影响力，是清华大学最顶尖的专业。