民办大学的建校区资金主要由 举办者自筹。具体来说，民办大学的用地一般是出让地，学校包括大学一般来说是国家创办，用地系划拨，校舍及配套也是由政府出资建设，这类学校是公办或公立学校。但改革开放后，民营或私营举办的学校包括大学也逐渐出现，它是教育体系的重要补充，特别是具有特色或个性化较强的教育，对完善教育体系有着很大作用。但民办大学是民营或私营，用地应该是出让，建设资金也由举办者自筹。
此外，举办民办学校可以用货币出资，也可以用实物、建设用地使用权、知识产权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资；但是，法律、行政法规规定不得作为出资的财产除外。举办营利性民办高中的资金是可以由举办者公司股东出的。因为营利性民办学校举办者就是营利性民办学校有限公司的股东，需要由董事会处理资金。学校一般是不适用公司法的，但对涉及到学校股东的权益的事情，可以适用其他民事法律的规定，例如民法通则等。
因此，民办大学的建校区资金主要来源于举办者的自筹，包括个人资金、企业投资、集资、入股或捐资等形式。