是的，民营大学三本算作本科。三本通常指的是全国普通高校招生统一考试中的第三批本科录取批次，虽然其办学性质和录取批次与民办本科有所不同，但三本院校也是国家承认的本科学历教育，学生毕业后的毕业证书和学位证书与公办本科相同，享有同等权利。
具体来说，民办大学包括三本院校，但不仅限于三本。民办大学的办学层次分为专科和本科，而三本院校主要是指在第三批本科批次进行招生的院校。有些民办院校经过国家评核也可以通过升级为二本院校。
因此，无论是从办学层次还是从社会认可度来看，民营大学三本都应当被认定为本科。在选择院校时，三本院校虽然可能在某些方面不如一本或二本院校，但其本科学历同样是受到国家承认和认可的。