三本大学在管理内部可能面临的风险主要包括以下几个方面：
内部管理风险
收费项目设立与审批流程：学校内部在收费项目设立、审批流程、票据管理等方面存在漏洞，可能导致自立名目收费等违规现象。例如，个别部门未经学校收费管理领导小组审批，擅自设立收费项目，如考试辅导费、教辅材料费等，引发“乱收费”问题。
财务管理风险
资金收缴与核算：在收费资金的收缴、核算、存储和使用过程中，若财务管理不规范，可能出现资金安全风险、财务报表失真等问题。例如，收费人员未及时将所收款项缴存至学校指定账户，存在挪用资金的风险；或者财务核算不准确，导致财务报表不能真实反映学校的收费情况。
信息系统风险
系统安全性：随着学校信息化程度的提高，收费系统的安全性和稳定性至关重要。若信息系统存在漏洞，可能导致学生和家长的个人信息泄露、收费数据错误等风险。例如，收费系统被黑客攻击，学生的缴费信息被窃取，或者系统故障导致收费数据丢失。
投资风险
项目选择风险：投资项目缺乏充分的可行性研究，可能导致投资失败，资金无法收回。
收益不确定性风险：如学校对外投资的企业经营不善，学校无法获得预期的投资回报。
流动性风险：长期投资项目过多，可能导致学校可支配的流动资金不足，影响日常运营。
资金运营风险
预算执行风险：预算编制不合理或预算执行不力，导致资金浪费或资金缺口。
资金周转风险：学费、住宿费等收入不能及时收取，或支出控制不当，造成资金周转困难。
财务内部控制风险：财务审批流程不严格，财务人员违规操作，导致财务损失。
管理风险
决策失误：高校内部管理者在工作上的判断失误、有效信息缺失或不对称、监管机制不健全等因素，可能导致管理不善问题。
建议
完善内部管理制度：
学校应建立健全的收费管理、财务管理和信息系统管理制度，确保各项收费项目合法合规，防止乱收费现象的发生。
加强财务监管：
定期对学校的财务状况进行审计，确保资金的安全和财务报表的准确性，防止资金被挪用或滥用。
提升信息系统安全性：
加大对收费系统的安全防护投入，定期进行系统维护和升级，确保学生和家长信息的安全。
严格投资决策：
在进行投资前，应进行充分的可行性研究，评估投资项目的风险和收益，避免盲目投资导致资金损失。
优化预算管理：
合理编制预算，严格执行预算，确保资金的合理使用和有效监控，防止资金浪费和资金缺口。
强化内部控制：
建立健全的内部控制体系，明确各级管理责任，加强对财务人员的培训和管理，防止财务违规行为的发生。