福建最好的食品专业大学有以下几所：
福建技术师范学院：
在食品科学与工程专业中排名第1。
福建农林大学：
在食品科学与工程专业中排名第2，在食品质量与安全专业中排名第6。
福建中医药大学：
在食品科学与工程专业中排名第3。
闽南科技学院：
在食品科学与工程专业中排名第4。
武夷学院：
在食品科学与工程专业中排名第5，在食品质量与安全专业中排名第3。
集美大学：
在食品科学与工程专业中排名第6，在食品质量与安全专业中排名第1。
闽南师范大学：
在食品营养与健康专业中排名第3。
建议根据具体专业选择学校时，可以综合考虑各大学的排名及专业特色，以找到最适合自己的院校。