二本和三本大学的存在主要是由于以下几个原因：
院校合并：
一些一本大学与二本大学合并，导致合并后的学校既有原本的一本专业，也有原本的二本专业。此外，有些大学为了响应国家或省里的号召，新设立了一些冷门专业或只对本省招生的专业，这些专业的师资力量较弱，就业情况一般，因此只能放在二本批次招生。
专业设置与实力差异：
大学的专业有强弱之分，一些王牌专业实力较强，因此放在一本招生，而相对弱一些的专业则放在二本招生。此外，有些专业是新开设的或只针对省内招生，这些专业由于师资力量和就业情况等原因，也只能在二本批次招生。
校区差异：
有些大学有多个校区，分校区在软硬件方面通常不如主校区，因此这些分校区只能放在二本或三本批次招生。例如，哈尔滨医科大学在一本招生，但其大庆校区在二本招生。
分批次录取：
我国高校录取分为多个批次，一本、二本和三本分别对应不同的录取分数线。这种分批次录取的方式是为了更好地选拔人才，将成绩优异的学生和有特殊技能和才艺的学生提前录取。
历史沿革：
虽然教育部并没有明确规定一本和二本的区别，但大家为了更好地区分大学，逐渐形成了这种习惯。以前，三本院校主要是民办或独立学院，这些院校在大部分省份已经取消，但在未取消之前，它们也是考生的重要选择之一。
政策调整：
近年来，教育部实行新高考报考政策，许多省份在填报志愿时采取本科合并的方式，即统一放在本科批次。这种政策调整也在一定程度上影响了二本和三本大学的存在。
综上所述，二本和三本大学的存在主要是由于院校合并、专业设置与实力差异、校区差异、分批次录取、历史沿革以及政策调整等多种因素共同作用的结果。随着教育改革的不断深入，未来可能会有更多的变化和调整。