三本大学既包括民办大学，也包括独立学院，但以民办为主。以下是具体的解释：
民办高校：
三本院校大部分为民办学校，这些学校通常由企业、事业单位、社会团体或个人出资建立，并在计划统招范围内享有与公办大学相同的待遇。
独立学院：
三本院校中还有一部分为独立学院，这些学院通常是依托一本或二本大学而设立，具有独立的法人资格和招生资格。独立学院在性质上属于民办，但在运营上可能与母体大学有一定的关联。
公办三本：
虽然三本院校以民办为主，但仍存在一些公办三本学校，这些学校通常由地方政府或教育部门主办，具有一定的教育资源和政策支持。
综合以上信息，可以得出结论：三本大学主要是民办高校，但也包括部分公办三本学校。学生在选择三本院校时，应注意区分其性质，选择具有统招资格的正规院校。