三本院校并不都是独立大学。三本院校主要是指 独立学院本科院校，它们通常具有“校园独立、招生独立、财务独立，但教学管理、师资力量和教学设施等资源都与校本部共享”等特点。然而，需要注意的是，随着教育改革的推进，大部分省份已经取消了三本招生，三本大学逐渐转变为独立院校或与二本、一本大学合并录取。
此外，三本院校并非全部是民办性质，也有部分独立学院是公办民助性质。独立学院可以是由普通高校申请和举办，利用非国家财政性经费举办的实施本科学历教育的高等学校，它们并不都是三本，也包括二本和一本。
综上所述，虽然三本院校中有一部分是独立学院，但并非所有三本院校都是独立大学。在选择三本院校时，考生应当仔细了解各个院校的属性，包括其办学性质、教育资源等，以确保选择到合适的院校。