三本大学的行政部门主要包括以下几类：
党委职能部门
党委办公室
纪委办公室
组织部
宣传部
统战部
学生工作部
机关党委
党委研究生工作部
党委保卫部
校工会
校团委
校友会
行政职能部门
校长办公室
研究生院
财务处
教务处
科学技术处
社会科学处
人事处
医务处
后勤处
基建处
科研院
科技推广处
人才工作办公室
国际合作与交流处（港澳台办）
计划财务处
国有资产管理处
监察处
审计处
后勤管理处
基建规划处
保卫处
离退休工作处
这些部门涵盖了大学日常运营和管理的各个方面，从教学、科研到学生事务、行政支持等。不同学校的行政部门设置可能会有所不同，具体配置以本校实际情况为准。