西安工程大学不存在对三本学生的歧视。以下是一些支持这一观点的信息：
公开信息：
有信息表明，西安工程大学每年都有三本民办院校的学生顺利上岸，这表明学校在招生过程中并没有对三本学生设置不公平的障碍。
公平性：
研究生入学考试（初试）是国家级考试，其公平性是有保障的。复试虽然由目标院校出题阅卷，但包括英语听力、专业课在内的笔试环节也是公平的。
难度和压分：
有学生反映，西安工程大学的专业课难度相对较低，只要认真学，一般不会低于120分。学校甚至将难度放到了最低，以鼓励学生报考。
综上所述，西安工程大学在招生过程中并没有对三本学生存在歧视行为，相反，学校提供了相对公平的考试和招生环境。建议学生在报考时可以根据自己的实际情况和兴趣，综合考虑学校的教学质量和研究方向，做出合适的选择。