三本大学和二本大学在多个方面存在明显的区别：
性质与财政资助
二本：主要是公办大学，享有国家财政资助，社会认可度较高。
三本：主要是民办大学，部分属于公办民助范畴，社会认可度相对较低。
录取批次
二本：录取批次通常在第二批，每个省份的具体情况可能有所不同。
三本：录取批次在第三批，但随着高考改革的推进，一些省份已经将二本和三本合并招生。
学费
二本：学费相对较低。
三本：学费相对较高，因为三本院校多为民办性质。
文凭含金量
二本：文凭含金量较高，在就业市场上具有较大优势。
三本：文凭含金量相对较低，就业时可能会受到一定程度的歧视。
社会认知
二本：普遍被认为是质量较高的本科教育。
三本：社会认知度较低，有时会被视为较次的选择。
尽管有些省份已经将二本和三本合并招生，并且合并后的毕业证书上没有标明是二本还是三本，但从本质上讲，二本和三本在办学性质、财政资助、社会认可度等方面仍然存在明显的差异。因此，建议学生在选择高校时，应充分考虑这些因素，选择最适合自己的学校。