全国最南端的大学包括以下几所：
云南大学：
云南大学是教育部直属全国重点大学，国家211工程，双一流建设高校B类，座落在云南省昆明市。
海南大学：
海南大学是教育部直属高校，是国家211工程重点大学，是“双一流”建设高校，是海南省最牛的大学。海南大学在2007年8月由原华南热带农业大学与原海南大学合并组建而成。
厦门大学：
厦门大学位于福建省，虽然地理位置较南，但并非最南端。
华侨大学：
华侨大学位于福建省，同样地理位置较南，但并非最南端。
琼州学院：
琼州学院是经国家教育部批准设立，位于祖国最南端的惟一一所公办省属普通全日制综合本科院校。
综上所述，全国最南端的大学包括云南大学、海南大学和琼州学院。