厦门大学自创立以来，历任校长如下：
邓萃英（芝园）- 1920.12 ~ 1921.05 教授
林文庆（梦琴）- 1921.06 ~ 1937.07 教授
萨本栋（亚栋）- 1937.07 ~ 1945.08 教授
汪德耀（伯明）- 1945.09 ~ 1949.10 教授
王亚南（渔邨）- 1950.05 ~ 1969.11 教授
曾鸣- 1978.04 ~ 1982.02 福建省人大常委会副主任
田昭武- 1982.02 ~ 1989.09 中科院院士
林祖赓- 1990.07 ~ 1999.04 教授
陈传鸿- 1999.04 ~ 2003.05 教授
朱崇实- 2003.05 ~ 2017.07 教授
张荣- 2017.07 ~ 2022.03 教授
张宗益- 2022.03 ~ 至今 教授
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