2016年医科大学的排名如下：
1. 北京协和医学院
2. 第三军医大学
3. 第二军医大学
4. 第四军医大学
5. 首都医科大学
6. 南方医科大学
7. 浙江大学
8. 天津医科大学
9. 南京医科大学
10. 山东大学
11. 武汉大学
12. 河北医科大学
13. 哈尔滨医科大学
建议：
北京协和医学院在2016年全国医科大学中排名第一，显示出其在医学领域的领先地位。
首都医科大学和南京医科大学在2016年的排名中也有显著提升，分别位列第四和第九。
选择医科大学时，可以根据自己的兴趣和专业需求，参考各大学的医学专业强项和排名情况。