三本大学毕业生申请日本研究生留学可以考虑以下几种途径：
语言学校途径
优势：门槛低，适合没有充分准备的同学。
缺点：需要直接接触日本社会，学习日语。
在国内申请国立大学研究生
优点：较为稳妥，可以积累研究经验。
缺点：竞争激烈，对出身校有一定要求。
直接申请G30项目的修士
优点：较为直接，适合英语较好的学生。
缺点：对日语能力要求较高。
直接去日本考修士
优点：节省时间，直接面对考试。
缺点：风险较高，需要较强的语言和学术能力。
申请要点：
学术成绩：提高GPA，尤其是专业课程成绩。
语言能力：日语N2以上或英语IELTS 6.0/TOEFL 80分以上。
研究计划书：撰写出色的研究计划书可以在书类选考中突出。
联系教授：通过邮件等方式联系目标研究室的教授，并可能需要面试。
经济规划：考虑学费和生活费，以及可能的奖学金机会。
注意事项：
日本对第一学历要求相对宽松，但GPA和专业成绩仍然重要。
直接申请修士可能比申请研究生难度更大，但有机会性。
经济条件允许的情况下，可以考虑私立大学，它们可能提供更多的奖学金机会。
考虑时间规划，提前准备，尤其是GPA的提升。
以上信息综合了多个时间点的数据和建议，具体情况还需根据个人情况和目标院校的具体要求来定