民办大学并不都是三本大学。民办高校指的是企业事业组织、社会团体及其他社会组织和公民个人利用非国家财政性教育经费，面向社会举办的高等学校及其他教育机构，其办学层次包括专科和本科。民办本科院校经过国家评核通过也可升级为二本院校。虽然绝大多数民办本科院校属于独立学院，在三本批次招生，但也有个别发展比较好的民办本科院校具备录取第二批的考生资格，甚至成立博士办学点，例如西湖大学。此外，有些省市已经取消了三本招生，将原来的三本批次学校合并到了二本批次，因此可能会出现600多分以上的高分考生考入民办大学或独立学院的情况。
综上所述，民办大学包括三本院校，但也有可能升级为二本院校，还有个别院校具备更为高级的招生资格。因此，不能一概而论认为民办大学都是三本大学。