东南大学院系编号如下：
建筑学院：001
机械工程学院：002
能源与环境学院：003
信息科学与工程学院：004
土木工程学院：005
电子科学与工程学院：006
数学系：007
自动化学院：008
计算机科学与工程学院：009
物理系：010
生物科学与医学工程学院：011
材料科学与工程学院：012
人文学院：013
经济管理学院：014
电气工程学院：016
外国语学院：017
体育系：018
化学化工学院：019
交通学院：021
仪器科学与工程学院：022
艺术学院：024
法学院：025
学习科学研究中心：041
基础医学院：042
公共卫生学院：043
临床医学院：061
吴健雄学院：071
软件学院：071
请注意，这些信息基于2024年5月1日的数据，院系编号可能会有变动，建议联系东南大学确认最新信息