选择闽台合作还是民办大学，取决于您的个人需求和发展目标。以下是两者的特点，供您参考：
闽台合作高校
教育资源：结合了福建和台湾的教育资源，注重培养学生的国际视野和创新能力。
课程设置：可能更接近台湾教育体系，提供更多的国际交流机会。
毕业证书：毕业证书落款为合作大学，与公办院校共享资源和校区。
优势：公办学校的办学条件、环境和资源通常更有优势，学习氛围、诚信度和负责任程度较高。
民办本科高校
市场化运作：学费相对较高，但教学质量和师资力量因校而异。
特色教育：强调市场导向和特色教育，注重实践能力和专业特色。
毕业证书：毕业证书上会有“XX大学XX学院”的字样。
优势：如果民办学校办学主体有良好的社会口碑，且您选择的专业在民办学校中有更好的发展，那么民办学校可能是一个不错的选择。
总结
如果您希望获得更多国际交流机会，培养国际视野和创新能力，并且不介意较高的学费，闽台合作高校可能更适合您。
如果您更注重实践能力和专业特色，或者希望选择学费相对较低的学校，同时对毕业证书的正规性有较高要求，民办本科高校可能是更好的选择。
请根据您的个人兴趣、专业需求、经济条件以及对未来职业规划的考虑，做出最适合您的选择