北京的三本大学在近年来经历了一些变化，根据提供的信息，我们可以了解到以下几点：
录取情况
近年来，北京的三本院校录取情况有所好转。例如，北京第二外国语学院中瑞酒店管理学院的报到率接近100%，北京工业大学耿丹学院的报到率超过了99%。
新生报到率
新生报到率普遍高于往年，这可能与家长和学生对专业的认同、对独立学院办学性质和教学方式的认可，以及学校开设的多元化专业有关。
院校发展
北京工业大学耿丹学院因其院长致力于改革，以及其优越的教学设施和校园环境，在最近的发展中受到了一定的青睐。
排名情况
在往年的北京三本大学排名中，首都师范大学德科学院位居榜首，北京工业大学耿丹学院排名第二。
生源危机
由于人口出生率下降，参加高考的人数减少，即便是三本院校也面临生源危机，一些考生选择复读或出国留学，导致实际参加高考的人数减少。
综上所述，北京的三本大学在新生报到率、院校改革和发展方面取得了一定的进展，但同时也面临着生源减少的挑战。