深圳的三本院校包括：
深圳大学：
深圳大学是深圳市的一所知名高校，为深圳乃至全国培养了大量的人才。该校在多学科领域都有较强的实力，特别是在工程、管理、文学、医学等领域有一定的优势。
南方科技大学：
南方科技大学是一所位于深圳市的顶尖研究型大学，采用自主招生模式，在全国15个省份计划招收优秀理科应届高中毕业生。
深圳技术大学：
深圳技术大学是一所注重职业教育和技能培训的高等学校，致力于培养应用型、技能型人才。
深圳职业技术大学：
深圳职业技术大学是一所专注于职业技能培训的大学，注重实践教学和产学研结合。
深圳理工大学：
深圳理工大学是一所正在筹建中的本科院校。
香港中文大学（深圳）：
香港中文大学（深圳）是一所由香港中文大学和深圳市政府合作举办的公办大学。
深圳北理莫斯科大学：
深圳北理莫斯科大学是一所由深圳市人民政府、北京理工大学和莫斯科罗蒙诺索夫国立大学合作举办的公办大学。
建议：
深圳大学和 南方科技大学是深圳市最为知名的两所综合性大学，适合追求学术研究和综合素质提升的学生。
深圳技术大学和 深圳职业技术大学则更侧重于职业技能和应用型人才的培养，适合希望快速就业的学生。
香港中文大学（深圳）和 深圳北理莫斯科大学等国际合作大学，提供国际化的教育资源和环境，适合希望接受国际化教育的学生。