北京中医药大学 至少有一个三本院校，即北京中医药大学东方学院。
1. 北京中医药大学东方学院是由北京中医药大学申办，2005年4月国家教育部批准，列入全国普通高校统一招生计划，实施本科层次教育的独立学院。根据公开信息，北京中医药大学东方学院在河北是本科批次招生，对于河北考生来说，通常认为北京中医药大学东方学院是本科大学。
2. 关于北京中医药大学的本科批次，教育部门并没有明确划分是一本还是二本，本科毕业证上显示的均为本科。但根据公开信息，北京中医药大学通常被认为是一本大学。
3. 北京中医药大学第三附属医院是北京市第一家集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的三级甲等中西医结合医院，但它不是一所本科院校。
综上所述，北京中医药大学有三本院校，即北京中医药大学东方学院。