在二本大学中，以下几所学校的木工工程专业相对较好：
长沙理工大学：
这所学校以工为主，多学科协调发展，具有博士后科研流动站、博士学位授予权和硕士生推免权。长沙理工大学在土木工程领域有较高的声誉，木工工程专业也可能较为出色。
吉林建筑大学：
前身是1956年国家城市建设部创建的长春城市建设工程学校，是吉林省唯一的土建类本科高等学校。吉林建筑大学在土木工程学科方面有着较好的表现，木工工程专业也可能较为优秀。
青岛理工大学：
这所学校以工为主，理工结合，土木建筑、机械制造、环境能源学科特色鲜明。青岛理工大学是山东省最早设立土木专业的学校，木工工程专业也可能较强。
华侨大学：
在上一轮教育部对土木工程学科评估中，华侨大学获得了不错成绩，虽然是一所二本院校，但其木工工程专业可能也有一定的实力。
北京建筑工程学院：
这所学校在土木工程学科评估中表现不错，虽然是一所二本院校，但其木工工程专业可能也较为出色。
广州大学：
广州大学在土木工程学科方面也有一定的实力，木工工程专业也可能较为优秀。
兰州理工大学：
兰州理工大学在土木工程学科方面表现不错，木工工程专业也可能较为出色。
华北水利水电学院：
这所学校在土木工程学科方面也有一定的实力，木工工程专业也可能较为优秀。
建议在选择学校时，可以综合考虑学校的整体实力、专业特色、师资力量以及就业情况等因素，以找到最适合自己的学校和专业。