民办大学毕业生在满足一定条件下是可以落户厦门的。以下是具体的落户条件：
全日制高校毕业生：
如果已经在本市就业，可以在毕业年份内按照应届毕业生身份落户。
全日制本科及以上学历毕业生：
如果已经在本市合法稳定就业，并且距离法定退休年龄5年以上，也可以落户。
非全日制博士研究生学历毕业生：
如果已经在本市合法稳定就业，并且距离法定退休年龄5年以上，也可以落户。
因此，民办大学的毕业生在符合上述条件的情况下，是可以通过相应的渠道将户口落在厦门的。建议您根据自身情况，了解并确认所需的详细材料和条件，以确保顺利落户。