西南大学确实 有三本学院。以下是相关信息的整理：
三本应用技术学院
该学院位于渝北区龙溪，学校环境可以，但住宿条件不佳，且校园规模较小。
本三育才学院
育才学院是西南大学的一个独立院校，在全国本三独立院校中排名较前，一般位于前20名。
毕业证书上印有“西南大学育才学院”的名字。
该学院设有某些本三专业，并且高职专业也招生，但高职专业不属于三本。
育才学院的学风较好，教师多来自校本部的优秀老师，因此师资不错。
重庆人文科技学院
该校是西南大学与企业合办的独立本科院校，成立于2000年5月，2013年4月经教育部批准转设为独立设置的普通本科高校。
该校在重庆的三本院校中办学起步较早，但位于合川的山里。
综上所述，西南大学确实设有三本学院，分别是应用技术学院和育才学院，而重庆人文科技学院虽然与西南大学合办，但作为独立本科院校，也属于三本院校范畴。
建议：
如果学生在考虑报考西南大学的三本学院，建议重点关注育才学院，因为它在独立院校中的排名较高，且师资力量雄厚。
重庆人文科技学院虽然地理位置较偏，但作为独立本科院校，也有一定的办学实力。