三本大学的学分学费计算方式如下：
学分学费制
学生学费由专业注册费和学分学费两部分构成。
学分学费按学生所修每门课程规定的课程学分收费，每学分学费为60元。
学年制收费标准
学分学费是指在标准学制内，以正常完成各专业培养计划规定的应修最低学分为计算基础，在学年制学费总额度内，由教务处提供课程计划（培养规划），财务资产处据此计算课程学分单价。
计算公式为：每学分学费 = （学年收费标准 × 学制）/ 毕业总学分。
专业注册费
专业注册费根据不同专业按下表收取，例如，某校的专业注册费为3000元/年。
学费结算
专业注册费按学年收取，在规定时间内交清专业注册费者允许注册和选课，否则不予注册和选课。
学分学费依据确认的选课结果收取，缴费成功者保留所有选课结果，否则取消所有选课结果。
其他费用
除了学分学费外，学生还需支付住宿费、教材代管费等额外费用。
建议
学生应仔细了解所在学校的具体学分学费计算方法和标准，以便准确计算和安排自己的学费支出。
学生在选择课程和重修时，应注意学分学费的计算方式，避免因未按时缴纳学分学费而影响选课和毕业。