国家取消三本大学的原因主要有以下几点：
三本院校含金量不高：
原本三本的分数线较低，大部分都是民办高校，其本科含金量不如公办的一本和二本大学，导致很多企业和用人单位对三本高校认可度不高。
学费昂贵：
三本大学一般为私立学校，学费较高，一般家庭难以承担，因此不如选择公办且学费较低的大专学校，导致三本学校的报考学生相对较少。
招生人数问题：
为了提高原本三本高校的招生人数，教育部将二本和三本高校放在一起让学生选择，对于分数不是很高但过了三本线的学生，可以选择公办二本学校。
毕业生就业困难：
三本大学的毕业生就业面临较大困难，未来发展存在不确定性。
与新时代人才培养不匹配：
三本大学的设置与新时代人才培养和产业结构变化的要求不太吻合，需要进行改革与调整。
教育资源分配：
分批次录取人为地将高校分为不同等级，不利于高校平等竞争，且可能导致学历歧视。
合并录取批次：
为了录取方便和提高教育质量，国家逐步合并本科批次录取，现在大部分省份已经实现二本和三本批次的合并。
综上所述，国家取消三本大学主要是基于提高教育质量、促进教育公平和适应新时代人才培养需求等多方面的考虑。