三本大学学费贵的原因主要有以下几点：
民办性质：
三本大学多为民办或独立院校，没有国家财政拨款，其运营和办学经费主要依赖学生缴纳的学费。
商业经营模式：
三本大学采用商业经营模式，投资商联合教育部门办校，所有投入资金由学生承担，而一本和二本的学校则有地方财政和国家教育部的联合财政补贴。
盈利目的：
三本大学的主要目的是盈利，学费是主要的收入来源之一。与公立大学以培养人才为主不同，三本大学需要通过学费来维持运营和实现盈利。
高成本投入：
三本大学的建设标准通常较高，提供更好的住宿条件和设施，如双人间或四人间宿舍、独立卫浴和空调等，这些都需要大量的经济支持。
教育资源：
三本大学在教学设备和教育资源上需要与一本和二本大学竞争，尽管社会对三本的认可度相对较低，但它们仍需提供高质量的教育以吸引学生，这也会反映在学费上。
经济压力：
三本大学的学生大多来自家庭经济条件相对较差的家庭，学费和生活费的高昂给这些学生带来巨大的经济压力。
综合以上因素，三本大学的学费之所以较贵，主要是因为它们作为民办或独立院校，缺乏国家财政的支持，必须通过学费来维持运营和实现盈利，同时它们在教学设施和学生生活条件上的投入也较高。