一本大学设有二本独立校区的大学包括：
深圳大学：
深圳大学是一所综合性大学，同时进行一本和二本招生，但据现有信息，深圳大学并没有明确的二本独立校区，而是在同一校区内设有不同批次的招生专业。
中山大学：
中山大学有多个校区，包括东校区、南校区、北校区和珠海校区。其中，天河区的新华学院和从化的南方学院是中山大学的独立学院，它们并不在中山大学的本校区内，可以被认为是二本独立校区。
南开大学滨海学院、 南京大学金陵学院、 浙江大学城市学院、 同济大学浙江学院、 中山大学南方学院、 四川大学锦城学院等：这些学院依托于母校的优质教育资源，学风较好，考研率较高，通常被认为是二本大学，并且有独立校区。
荆州的长江大学、 宜昌的三峡大学、 荆门的荆楚理工学院、 恩施的湖北民族学院等：这些学院位于各自的城市，由于城市优势和管理效率，通常被认为是二本大学，并且有独立校区。
建议在选择学校时，可以综合考虑学校的整体实力、专业设置、学风以及地理位置等因素，以确保选择到最适合自己的学校。