是的，民办大学需要依法纳税。根据中国的税收法规，民办大学作为独立法人，需要缴纳以下几种税费：
企业所得税：
民办大学的收入需要缴纳企业所得税，具体税率和计算方法根据其收入性质和用途确定。
增值税：
提供教育服务所获得的收入可能需要缴纳增值税。
教育费附加和地方教育附加：
基于增值税的一定比例征收。
其他地方税种：
如房产税、土地使用税等。
民办大学在享受国家政策扶持的同时，也要履行相应的纳税义务。此外，根据《民办教育促进法实施条例》，捐资举办的民办学校或出资人不要求取得合理回报的民办学校，依法享有与公办学校同等的税收及其他优惠政策。
需要注意的是，税收政策可能会有更新和调整，具体情况应以最新的法律法规为准。