上海医学的三本大学排名如下：
上海交通大学医学院
上海交通大学医学院的前身是著名的上海第二医科大学，具有60多年的办学历史。该校在全国的医学院中排名非常靠前，属于顶级医学院校。
复旦大学上海医学院
复旦大学上海医学院最早可追溯到上世纪二十年代的国立中央大学医学院，是我国创办的第一所国立大学的医学院。该校在首批一级博士点数量上全国最多，实力非常强悍，其临床医学专业尤为出名。
第二军医大学
第二军医大学，即中国人民解放军海军军医大学，是国家211工程、军队2110工程和原总后勤部530工程重点建设院校，首批国家“双一流”世界一流学科建设高校。该校在军队研究生培养方面也占据重要地位。
建议：
上海交通大学医学院和 复旦大学上海医学院均属于国内顶尖的医学院校，实力非常强，建议优先考虑。
第二军医大学作为军队院校，在特定领域如军事医学等方面具有独特优势，也值得考虑。