南京的本三大学包括以下几所：
三江学院
东南大学成贤学院
南京大学金陵学院
南京理工大学紫金学院
南京航空航天大学金城学院
中国传媒大学南广学院
南京工业大学浦江学院
南京师范大学中北学院
南京信息工程大学滨江学院
南京审计学院金审学院
南京理工大学泰州科技学院
南京师范大学泰州学院
南京医科大学康达学院
南京邮电大学通达学院
金陵科技学院龙蟠学院
南京中医药大学翰林学院
南京艺术学院
南京财经大学红山学院
南京工程学院康尼学院
中国药科大学
建议在选择三本大学时，可以综合考虑学校的学科特色、教学质量、就业前景等因素，以便找到最适合自己的学校。