当前交通部直属的大学包括：
大连海事大学
主管部门：交通运输部
所在地：辽宁大连
层次：本科
备注：公办，国家“211工程”和“双一流”建设高校。
中国民航大学
主管部门：交通运输部（中国民用航空局）
所在地：天津
层次：本科
备注：公办，国家“双一流”建设高校和高水平特色大学建设高校。
中国民用航空飞行学院
主管部门：交通运输部（中国民用航空局）
所在地：四川德阳
层次：本科
备注：公办。
上海民航职业技术学院
主管部门：交通运输部（中国民用航空局）
所在地：上海
层次：专科
备注：公办。
广州民航职业技术学院
主管部门：交通运输部（中国民用航空局）
所在地：广东广州
层次：专科
备注：公办。
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